本作品由2部分组成,自小说《Thunderbolt Fantasy 东离剑游纪 外传》中收录的「杀无生篇」及虚渊玄亲自执笔的新作短篇「殇不患篇」。「杀无生篇」为《Thunderbolt Fantasy 东离剑游纪》的前传故事,以凛雪鸦性命为目标,执拗追杀着他的杀无生,过去与凛雪鸦的一段因缘将在此揭明。「殇不患篇」为虚渊玄亲自执笔撰写的《Thunderbolt Fantasy 东离剑游纪》后传故事,在与蔑天骸、玄鬼宗、魔神等一战过后,东离再度恢复和平。与丹翡、卷残云他们告别,继续着旅程的殇不患,来到了一家冷清的客栈酒馆。而在那里,他遇上了一个男人……
《EVA 新世纪福音战士新剧场版3.33:YOU CAN (NOT) REDO》。在第二部《破》的尾段,明日香不幸被第三使徒精神污染及侵食,生死未卜,但在最后的预告中却出现了戴着眼罩的明日香。而这样的独眼明日香就是驾着『改二号机』,在本作最先出场。时间已是《破》完结的14年之后,明日香28岁,而美里已经40多岁了!第三新东京市已消失……葛城美里带领着原属NERV的一些人员,脱离了NERV,成立了新的组织WILLE与NERV对抗,目标是要歼灭所有隶属NERV的EVA。铃原东治的妹妹也在美里这个组织工作。在本作出场的还有渚薰,他将与被封印在初号机里14年后,苏醒过来的真嗣一起驾驶13号EVA出动。